目前并没有科学依据说明南瓜不能与别的食物一起吃，而且由于南瓜含有多种营养物质，适量食用还有益于人体健康，因此可根据个人情况选择喜好的食物与南瓜一起搭配食用。
南瓜中含有丰富的维生素、矿物质、膳食纤维以及植物化学物，如维生素C、钙、钾、钠、镁、类胡萝卜素、活性蛋白等，可补充机体每日所需的微量元素。另外，南瓜中含有的果胶成分能够保护胃黏膜、促进胃肠蠕动，进而改善消化功能。在中医方面，通常认为南瓜还可以帮助化痰排脓，具有除湿祛虫、退热消肿等作用。
但是需要注意，南瓜虽对人体有一定的好处，但是不宜多吃，以免引起胃肠功能紊乱。对于正在服用药物的人群来说，是否能够食用南瓜可以咨询医生意见。
另外，有些人认为南瓜不宜与富含维生素C的水果、蔬菜一起吃，因为南瓜中含有维生素C分解酶，和富含维生素C的食物一起吃会降低维生素C的含量。但其实这种说法是不对的，因为南瓜烹饪后，高温会导致南瓜中含有的维生素C分解酶失活，从而失去分解作用，所以二者一起食用通常不会引起不良反应。